Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLE2P56282 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE2P56282 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE2P56282 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE2P56282 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE2P56282 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE2P56282 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE2P56282 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE2P56282 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLE2P56282 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLE2P56282 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLE2P56282 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLE2P56282 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
POLE2P56282 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE2P56282 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLE2P56282 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE2P56282 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE2P56282 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLE2P56282 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLE2P56282 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLE2P56282 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLE2P56282 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE2P56282 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms