Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIF1P55008 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIF1P55008 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIF1P55008 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIF1P55008 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIF1P55008 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms