Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFNA4P52798 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNA4P52798 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms