Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SMARCA2P51531 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SMARCA2P51531 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms