Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN1P49768 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSEN1P49768 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms