Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC11A1P49279 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A1P49279 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms