Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC10P48553 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms