Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX9P48436 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX9P48436 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX9P48436 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX9P48436 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX9P48436 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX9P48436 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX9P48436 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX9P48436 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX9P48436 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX9P48436 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX9P48436 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX9P48436 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX9P48436 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX9P48436 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX9P48436 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX9P48436 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX9P48436 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms