Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RANGAP1P46060 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RANGAP1P46060 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RANGAP1P46060 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms