Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPHP41219 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPHP41219 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPHP41219 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPHP41219 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPHP41219 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPHP41219 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPHP41219 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPHP41219 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPHP41219 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPHP41219 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPHP41219 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPHP41219 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPHP41219 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPHP41219 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPHP41219 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPHP41219 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPHP41219 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPHP41219 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPHP41219 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPHP41219 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPHP41219 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPHP41219 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPHP41219 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms