Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX2P40425 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX2P40425 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PBX2P40425 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PBX2P40425 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PBX2P40425 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PBX2P40425 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PBX2P40425 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms