Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCGF2P35227 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms