Protein–RNA interactions for Protein: P35219

CA8, Carbonic anhydrase-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA8P35219 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA8P35219 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA8P35219 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA8P35219 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA8P35219 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA8P35219 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA8P35219 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA8P35219 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA8P35219 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA8P35219 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CA8P35219 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA8P35219 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA8P35219 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA8P35219 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA8P35219 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA8P35219 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA8P35219 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CA8P35219 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA8P35219 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA8P35219 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms