Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM5P33992 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM5P33992 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM5P33992 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM5P33992 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM5P33992 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM5P33992 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM5P33992 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM5P33992 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM5P33992 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM5P33992 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM5P33992 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms