Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNTFRP26992 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNTFRP26992 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms