Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGA6P23229 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms