Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGFR3P22607 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms