Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARF4P18085 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARF4P18085 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF4P18085 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF4P18085 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF4P18085 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF4P18085 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF4P18085 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF4P18085 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF4P18085 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms