Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3L1P16619 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCL3L1P16619 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms