Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME1P15531 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME1P15531 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME1P15531 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME1P15531 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NME1P15531 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME1P15531 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME1P15531 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME1P15531 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME1P15531 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME1P15531 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME1P15531 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME1P15531 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms