Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP2C9P11712 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYP2C9P11712 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP2C9P11712 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms