Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GLI3P10071 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI3P10071 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI3P10071 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI3P10071 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI3P10071 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI3P10071 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GLI3P10071 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GLI3P10071 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLI3P10071 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI3P10071 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GLI3P10071 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLI3P10071 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLI3P10071 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GLI3P10071 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLI3P10071 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLI3P10071 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLI3P10071 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLI3P10071 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLI3P10071 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLI3P10071 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLI3P10071 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI3P10071 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI3P10071 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI3P10071 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI3P10071 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI3P10071 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI3P10071 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI3P10071 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI3P10071 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI3P10071 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms