Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNHG28P0DPA3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms