Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM225BP0DP42 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms