Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RGPD1P0DJD0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD1P0DJD0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms