Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L7P0C7H9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L7P0C7H9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms