Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP3P08254 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP3P08254 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP3P08254 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP3P08254 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP3P08254 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP3P08254 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP3P08254 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP3P08254 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP3P08254 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP3P08254 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP3P08254 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP3P08254 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP3P08254 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP3P08254 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms