Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPRAP08240 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms