Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED1O96006 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms