Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN11O75508 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms