Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG3O60359 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms