Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTN4O43707 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN4O43707 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms