Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM44O43615 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms