Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLGNO14967 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLGNO14967 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLGNO14967 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLGNO14967 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLGNO14967 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLGNO14967 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLGNO14967 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLGNO14967 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLGNO14967 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms