Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAMP3O14828 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAMP3O14828 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms