Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFRA2O00451 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFRA2O00451 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms