Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms