Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL1BA8MQ27 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms