Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PP2D1A8MPX8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms