Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KNCNA6PVL3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms