Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL1A6NKG5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms