Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.58■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMB4A4D0S4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms