Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQF3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms