Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrit3W8DXL4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit3W8DXL4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit3W8DXL4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrit3W8DXL4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrit3W8DXL4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit3W8DXL4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit3W8DXL4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrit3W8DXL4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrit3W8DXL4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit3W8DXL4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms