Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ilf3Q9Z1X4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ilf3Q9Z1X4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ilf3Q9Z1X4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ilf3Q9Z1X4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ilf3Q9Z1X4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ilf3Q9Z1X4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ilf3Q9Z1X4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms