Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp4Q9Z1N6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp4Q9Z1N6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp4Q9Z1N6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sfrp4Q9Z1N6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sfrp4Q9Z1N6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp4Q9Z1N6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms