Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cacna2d3Q9Z1L5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cacna2d3Q9Z1L5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Cacna2d3Q9Z1L5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cacna2d3Q9Z1L5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Cacna2d3Q9Z1L5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Cacna2d3Q9Z1L5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,72
Cacna2d3Q9Z1L5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cacna2d3Q9Z1L5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Cacna2d3Q9Z1L5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cacna2d3Q9Z1L5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Cacna2d3Q9Z1L5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Cacna2d3Q9Z1L5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,7 ms