Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dctn3Q9Z0Y1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn3Q9Z0Y1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn3Q9Z0Y1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dctn3Q9Z0Y1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn3Q9Z0Y1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn3Q9Z0Y1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn3Q9Z0Y1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms