Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IncenpQ9WU62 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
IncenpQ9WU62 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IncenpQ9WU62 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
IncenpQ9WU62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
IncenpQ9WU62 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
IncenpQ9WU62 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
IncenpQ9WU62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
IncenpQ9WU62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
IncenpQ9WU62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IncenpQ9WU62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IncenpQ9WU62 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
IncenpQ9WU62 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IncenpQ9WU62 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IncenpQ9WU62 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IncenpQ9WU62 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IncenpQ9WU62 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IncenpQ9WU62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
IncenpQ9WU62 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IncenpQ9WU62 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IncenpQ9WU62 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IncenpQ9WU62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
IncenpQ9WU62 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IncenpQ9WU62 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IncenpQ9WU62 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
IncenpQ9WU62 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
IncenpQ9WU62 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
IncenpQ9WU62 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
IncenpQ9WU62 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
IncenpQ9WU62 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IncenpQ9WU62 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
IncenpQ9WU62 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IncenpQ9WU62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IncenpQ9WU62 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IncenpQ9WU62 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IncenpQ9WU62 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IncenpQ9WU62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IncenpQ9WU62 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
IncenpQ9WU62 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IncenpQ9WU62 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
IncenpQ9WU62 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IncenpQ9WU62 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
IncenpQ9WU62 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms