Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
AtrnQ9WU60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AtrnQ9WU60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AtrnQ9WU60 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AtrnQ9WU60 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AtrnQ9WU60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
AtrnQ9WU60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AtrnQ9WU60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AtrnQ9WU60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
AtrnQ9WU60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
AtrnQ9WU60 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
AtrnQ9WU60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
AtrnQ9WU60 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AtrnQ9WU60 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
AtrnQ9WU60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AtrnQ9WU60 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AtrnQ9WU60 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
AtrnQ9WU60 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
AtrnQ9WU60 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
AtrnQ9WU60 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
AtrnQ9WU60 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
AtrnQ9WU60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AtrnQ9WU60 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
AtrnQ9WU60 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AtrnQ9WU60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AtrnQ9WU60 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
AtrnQ9WU60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
AtrnQ9WU60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
AtrnQ9WU60 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
AtrnQ9WU60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
AtrnQ9WU60 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
AtrnQ9WU60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
AtrnQ9WU60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
AtrnQ9WU60 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
AtrnQ9WU60 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
AtrnQ9WU60 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
AtrnQ9WU60 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
AtrnQ9WU60 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
AtrnQ9WU60 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
AtrnQ9WU60 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
AtrnQ9WU60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
AtrnQ9WU60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
AtrnQ9WU60 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
AtrnQ9WU60 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
AtrnQ9WU60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AtrnQ9WU60 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AtrnQ9WU60 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AtrnQ9WU60 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AtrnQ9WU60 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AtrnQ9WU60 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AtrnQ9WU60 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
AtrnQ9WU60 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
AtrnQ9WU60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AtrnQ9WU60 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
AtrnQ9WU60 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AtrnQ9WU60 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AtrnQ9WU60 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AtrnQ9WU60 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AtrnQ9WU60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AtrnQ9WU60 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
AtrnQ9WU60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
AtrnQ9WU60 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AtrnQ9WU60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
AtrnQ9WU60 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AtrnQ9WU60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
AtrnQ9WU60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
AtrnQ9WU60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
AtrnQ9WU60 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
AtrnQ9WU60 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
AtrnQ9WU60 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
AtrnQ9WU60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AtrnQ9WU60 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
AtrnQ9WU60 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AtrnQ9WU60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AtrnQ9WU60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms